全民奇迹2中需要队友协作完成的副本主要包括组队副本、跨服攻城战、万魔塔以及部分高难度剧情副本。这些副本设计强调团队配合，要求玩家在职业搭配、战术执行和资源分配上形成互补。其中组队副本和跨服攻城战对团队默契度要求最高，而万魔塔高层挑战则考验队伍的持续作战能力。合理配置战士、法师、牧师等职业的比例，是通关这类副本的基础条件。
组队副本作为核心协作玩法，每日可挑战次数有限但奖励丰厚。血色城堡、恶魔广场等副本需4人组队，BOSS战阶段需明确分工，坦克职业吸引仇恨，输出职业集中火力，治疗职业保障生存。副本中机关破解环节需特定职业参与，例如暗影猎手的陷阱解除技能。通关评分与时间挂钩，SSS评级要求队伍在1分钟内击败最终BOSS，这需要提前规划技能释放顺序和走位路线。副本掉落的卓越装备和精炼材料是角色成长的关键资源。
跨服攻城战采用多军团混战模式，战盟需提前分配攻城组与防守组。S级主城争夺中，积分累积策略比即时战斗更重要，建议战盟在活动前两周集中资源培养核心成员。攻城阶段需消耗罗兰战令宣战，战盟需根据敌方阵容调整职业配比，通常建议配置30%控制系法师和20%治疗职业。占领城池后每小时可领取配方礼盒，其中2号炼金台区域的史诗道具掉率比其他区域高15%。
万魔塔作为渐进式挑战副本，每10层会出现质变难度。队伍建议携带至少1名禁法师提供群体控制，搭配圣射手维持团队续航。高层挑战中，炎龙等BOSS的狂暴机制要求队员同步使用抗性药剂，药剂配方可通过周常任务炼金大师的考验获取。45层后会出现双BOSS同场战斗，需采用分拉战术避免技能叠加伤害。通关奖励包含羽毛、神鹰火种等稀有材料。
高难度剧情副本如绝禁之门要求队员达到60级并配备三转装备。副本中的禁地领主拥有范围秒杀技能，需通过牧师净化debuff和骑士格挡机制化解。队伍成员需提前分配好复活石使用顺序，避免同时阵亡导致团灭。部分隐藏房间需要收集4个旋转圆球机关解锁，这类解谜环节建议由远程职业负责操作。副本最终宝箱有概率开出大天使武器碎片，20个碎片可合成完整武器。
时间限制类副本时空裂隙在每周日12:00-14:00开放，隐藏房间探索需依赖队伍整体输出效率。建议组建固定队伍并采用语音沟通，实时调整技能循环和走位策略。活动期间可使用多倍经验丹提升收益，但需注意经验加成对副本评级无影响。团队副本的进度共享机制允许中途更换队员，但新成员无法获取已完成的章节奖励。
